Người Nhện Siêu Đẳng - The Amazing Spider-Man tiếp tục câu chuyện với cậu bé Peter, khi cha mẹ của cậu biến mất một cách bí ẩn và đã để cậu lại cho gia đình của cô chú nuôi dưỡng từ bé đến khi câu trưởng thành. Vì sự tò mò về thân phận thật sự của mình và cha mẹ mình là ai điều đó đã khiến bắt đầu cuộc hành trình tìm kiếm với những manh mối đễ lại. Nó dẫn Peter đến một tập đoàn Oscorp, tại đây cậu vô tình gặp nạn và khiến cậu trở thành một siêu anh hùng có năng lực của loài nhện. Từ đó, cậu chế tạo một bộ áo người nhện và làm siêu anh hùng giúp đỡ mọi người một cách bí ẩn trong thành phố New York.